과제명 : Electron Transfer Dissociation MS를 이용한 단백질과 펩타이드서열분석

분석구분

미래유망기술분석

과제수행자

엄*윤

분석일

2008-04-25 11:18:08.0

기술산업분류

바이오

작성기관

엄태윤

키워드

질량분석  펩타이드  

과학기술표준분류

내용

초기의 질량분석에 의한 단백질 분석은, 분리된 단백질을 효소 분해하여 생성된 펩티드의 분자량을 질량분석으로 측정하여 분해된 단백질 데이터베이스 검색을 통한 확인을 하는 “Peptide mass fingerprinting”기술이 개발되었다. 그 후에 GC-MS 기술의 진보에 따라 전체 단백질체를 효소 분해하고, 펩티드들을 GC로 분리한 후에 Tandem Mass Spectrometry(MS/MS)로 분리된 펲티드들을 확인하는 “Shotgun Proteomics" 기술이 개발되었다(3). 최근에는 단백질을 직접 분석하는 ”Top-down Proteomics"도 개발 중에 있다(4). 이러한 단백질 분석기술의 중심에는 질량분석기술의 개발이 대단히 중요한 위치를 차지하고 있다.
선택된 전구 펩티드이온의 충돌-활성화를 통한 에너지 재분배과정에서 가장 약한 결합의 절단이 일어난다. 펩티드 이온들이 중요한 번역 후 변형(Post- translational Modification, PTM)을 함유하게 되면 아마이드 골격 절단에 우선하여 변형 위치에서의 절단이 일어나게 된다. 예를 들면, 인산화 펩티드에서는 인산기가 골격의 아미이드기와 경쟁적인 양성자화를 하고 결과적으로 펩티드 이온으로부터 인산이 제거되는 m/z가 나타나 골격결합의 절단에 의한 펩티드 이온 조각들을 관찰할 수 없어 아미노산 서열을 알 수가 없다. 이러한 CAD-MS에 의한 전 단백질체 분석(Global Proteomics)의 한계는 새로운 이온화기술의 개발이 필요하게 되었다.

분석물

이미지변환중입니다.

등록된 분석물이 없습니다.