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DNA-암호화 화합물 문고 - 선도 물질 발견의 토대와 적용

전문가 제언

관심 있는 단백질에 대한 특이한 리간드를 분리하는 일이 약제나 생화학적 탐침을 개발하는데 중요한 단계이다. 리간드 발견을 쉽게 하는 기술이 생물학적 과정을 더 잘 이해하고 그리고 약물을 발견하는데 실질적으로 기여할 수 있다. 종래의 HIS(High Throughput Screening)1백만이나 되는 화합물 문고로부터 활성 분자를 찾아내기에는 문고합성, 조작 및 선별이 너무 복잡하고 비용이 많이 든다.

 

Phage display technology는 생합성 생성물(예로, polypeptide)의 선별에 적용할 수 있지만 작은 유기 리간드의 발견에는 사용할 수 없다. 그래서 최근에 개발된 방법이 DNA-encoded chemical library(DECL)이다. 작은 유기분자에 구별할 수 있는 DNA 조각을 결합한 수백만에서 수십억 개에 이르는 다른 분자들을 합성한다.

 

DECL 합성은 아미드결합형성 반응, 또는 Diels-Alder 고리첨가 반응을 사용하고, 한편 다른 반응도 사용할 수 있다. 수만에서 수십억의 다양한 분자를 합성할 수 있는 방법이 ‘Split(나누고)and Pool’(혼합하다)접근법이다. 먼저 oligonucleotide에 구성단위체(building block)를 결합시키고 두 번째, 첫 번 반응물을 섞은 후 각각의 반응용기에 나누고 두 번째 DNA-encoded chemical library를 생성한다. 이 절차를 반복하여 큰 크기의 문고를 얻는다.

 

이 문고로부터 표적 단백질에 결합하는 작은 유기분자를 찾아내야 한다. 고체 지지물에 고정한 표적 단백질에 합성한 DECL를 섞어서 배양하여 단백질에 결합시킨다. 결합하지 않을 것을 씻어서 제거하고 결합한 분자에 있는 DNA를 분리하여 PCR에 의해 증폭시키고 그리고 이 DNA의 염기순서를 결정하여 결합한 유기분자를 확인한다. 이 유기분자를 재합성하여 많은 양을 얻는다.

 

새로운 약제의 발견에서 중심적인 문제는 특이하게 결합하는 분자의 분리이며, 또한 단백질의 생물학적 기능을 밝히는데도 활성이 있는 작은 분자의 분리는 매우 중요하다. DNA-encoded chemical library는 각광을 받고 있으며 이 방법을 이용한 연구가 활발히 진행되고 있다.

저자
Gunther Zimmermann and Dario Neri
자료유형
니즈학술정보
원문언어
영어
기업산업분류
식품·의약
연도
2016
권(호)
21(11)
잡지명
Drug Discovery Today
과학기술
표준분류
식품·의약
페이지
1828~1834
분석자
서*림
분석물
담당부서 담당자 연락처
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