생명계통수에 유전체 ‘잎'을 추가

전문가 제언

현재 환경조사결과 작은 소단위 리보솜RNA나 메타유전체 데이터를 기초하여 적어도 60여개의 박테리아 또는 고세균(Archaea) 문(phyla)이 인정되고 있다. 그러나 많은 문은 현재의 균주보존기관이 의료나 산업적으로 중요한 미생물에 편향되었기 때문에 배양된 대표적인 종이 없거나 매우 적은 종이 포함된다. 따라서 미생물생명에 대한 우리의 이해는 큰 차이가 있다. 표적으로 하고 계통발생학적으로 다양한 배양된 분리균주의 유전체를 서열 분석하여 참조 데이터베이스를 개선한 박테리아와 고세균 프로젝트의 유전체 Encylopedia는 중요한 발전이었다.

 

그러나 배양 균주에 초점을 맞춤으로써 모든 종의 대다수를 대표하는 실험실에서 배양할 수 없는 미생물은 포함되지 않았다. 단세포 유전체학과 메타유전체학은 이 문제를 접근하는 두 방법을 제공한다. 단세포 유전체학의 경우 환경시료에서 각 세포(미생물)를 분리하여 DNA를 증폭시킨 다음 서열을 분석한다. 반면에 메타유전체학의 경우는 직접 환경 시료에서 DNA를 추출하여 shotgun-서열 분석 후에 조립한다.

저자

Alan Walker

자료유형

연구단신

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2014

권(호)

12()

잡지명

Nature Reviews Microbiology

과학기술
표준분류

바이오

페이지

78~78

분석자

민*익

분석물

• 생명계통수에 유전체 ‘잎'을 추가.pdf [240,788 byte]

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