폴리(A) 테일 평가: deep-시퀀싱에서의 통찰

전문가 제언

poly(A)테일의 세계적 연구는 기술도전에서 소외되어왔다. 최근 발전에서, 두 그룹이, 고-정밀도의 poly(A)테일-길이와 시퀀스에 대한 정보를 세계적으로 얻을 수 있는 ‘deep sequencing’을 개발하여, mRNA 대사에서의 poly(A)테일 기능 연구의 새로운 장을 열고 있다. 이 방법의 최초 적용에서, poly(A)테일 길이와 번역적 효율성 간의 관계, 그리고 3’말단 전사에 만연된 우리딘-화와 구아닌-화 확인에 대한 통찰을 밝힌다.

 

진핵세포의 대부분 성숙 mRNAs의 3’말단을 구성하는 poly(A) 테일이, mRNA 안정과 번역에 중요한 역할을 한다는 것은 잘 정립되었다. poly(A) 테일 길이 조절은, 초기발육, 염증, 습득과 기억 같은 과정에서의 유전자발현에 영향한다. 개별유전자 poly(A) 테일 길이가 생화학적 방법으로 정확히 측정될 수 있지만, 과거의 전장게놈 분석으로는 한계가 있다. deep-시퀸싱 기술 출현으로 RNA 연구가 풍성해졌다. 그러나 단일중합체(동일 뉴클레오티드 스트링) 시퀀싱의 어려움은 deep-시퀀싱에 의한 정확한 poly(A)테일 길이 측정을 방해하였다. Subtelny 등과 Chang 등은, 이 문제를 해결하기 위해, 최근 두 방법을 개발하였는데, 즉 시퀀싱(PAL-seq)과 TAIL-seq에 의한 poly(A) 테일 길이 프로파일링이다. Illumina 플랫폼에 대해 고안된 두 방법에는, cDNA 라이브러리를 마련하는 대체로 유사한 전략이 수반된다. 주요 차이는 시퀀싱 단계이다.

저자

Dinghai Zheng and Bin Tian

자료유형

연구단신

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2014

권(호)

39(6)

잡지명

Trends in Biochemical Sciences

과학기술
표준분류

바이오

페이지

255~257

분석자

김*범

분석물

• 폴리(A) 테일 평가; deep-시퀀싱에서의 통찰.pdf [261,202 byte]

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