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첨단기술정보

생체 조직내 RNA 서열분석

전문가 제언: 생물체에서 유전자 발현을 완벽히 설명하는 것은 모든 세포내의 전사체(transcriptome)의 정확한 서열과 위치를 제공할 수 있다. 이 목적을 이루기까지 아직 멀었으나, 수십 년간 서열분석과 이미징의 기술적인 발전을 통해 큰 진보가 이루어졌다. 한편으로, RNA 서열분석(RNA sequencing, RNA- seq)은 보통 세포군의 세포유전체 수준 스케일에서 유전자의 발현을 측정하는 것을 가능하게 하였다.

반면에 RNA 형광 in situ(생체 조직내) 혼성화(FISH)는 단일세포의 각각의 RNA분자를 현미경을 통해 측정할 수 있는 진보를 이루었다. 세포 이하 수준까지 내려가 RNA 위치 정보와 함께 정확하고, 절대적인 단일세포 발현 데이터를 얻으나 보통 동시에 몇 개의 유전자만에만 사용된다.

Lee는 Science에 in situ 단일 세포내에서 RNA 서열분석을 위한 방법들의 가장 좋은 것들을 결합한 연구를 보고하였다. 이 접근법을 형광 in situ RNA 서열분석 혼성화(FISSEQ)라고 불렀으며, RNA 위치에 대한 공간적인 정보를 보전하면서 세포를 시퀀싱 칩으로 사용했다.