미생물학과 proteomics 두 영역의 이점

전문가 제언

○ 최신 혼성고해상도 질량분석기로 단백의 고속 동정은 미생물학의 새로운 시각을 전개하고 있다. 특히 tandem 질량분석기술과 shotgun proteomics 바이오정보는 2차원 폴리아크릴아미드 겔 전기영동(two- dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, 2D-PAGE) 접근을 무력화하였다.

○ 대다수 단백질체 플랫폼 구축에 있어 표식기술보다는 비-표식정량접근의 일반화는 수행이 보다 용이하면서 정량결과도 강력하기 때문으로 질량분석데이터를 기록하는 각종 파라미터는 신중하게 선택하여 결과에 대한 신뢰성을 높일 수 있는 적절한 통계기법이 수행되어야 한다.

○ 더욱이 차세대 시퀀스방법은 어떤 미생물모델의 단백질체도 신속히 접근할 수 있어 다양한 환경에 따라 광범위한 미생물을 규명할 수 있게 되었다. 특히 미생물 단백질체를 이용한 최근 발견은 생물학적 정설까지도 도전하게 되었다.

○ 미생물 다양성과 생리는 단백질체의 비교분석을 통한 재검에서 수천 개의 단백질을 검출 및 정량하였고, 보다 양호한 게놈 주석으로 구성된 proteogenomics는 미생물학의 통합 multi-omic 접근을 살펴보게 되었다. 또한 meta-proteomic 툴을 이용한 접근에서는 미생물계의 복잡한 장벽을 헤쳐나아가 미생물 공동체의 기능까지도 평가하게 되었다.

○ 국내에서는 난배양성 극한미생물의 유전체·단백질체 분석 및 활용을 위한 플랫폼 기술 개발을 비롯하여 전통발효식품의 단백질체 연구, 기능성·품질증진을 위한 미생물유전체 연구, 혐기성 미생물 유래 셀룰라아제 복합체 셀룰로좀의 오믹스 및 고효율 농업부산물의 바이오에탄올 생산화 등 이 분야연구가 활발히 수행되어 향후 결과가 주목된다.

 

저자

J. Armengaud

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

환경·건설

연도

2013

권(호)

15(1)

잡지명

Environmental Microbiology

과학기술
표준분류

환경·건설

페이지

12~23

분석자

한*빈

분석물

• 미생물학과 proteomics 두 영역의 이점.pdf [381,705 byte]

이미지변환중입니다.