식물 마이크로 RNA의 진화역사

전문가 제언

○ 이 논문은 지금까지 발표된 miRNA에 관련된 논문을 검토하여 식물 miRNA의 진화과정에 관련된 여러 가지 증거들을 설명하고 있으며 그리고 정확하게 해석된 식물 miRNA를 구별하고 그리고 이용할 수 있는 오염되지 않은 데이터베이스를 구축하는 것이 앞으로의 연구를 위해 필요하다는 것을 말하고 있다.

 

○ miRNA는 식물의 발달과 생리에 중요한 역할을 하는 아미노산을 코딩하는 짧은 조절유전자이다. 차세대 염기서열결정 기술 및 생물정보학의 발전과 더불어 식물종의 miRNA의 연구(miRNAome)가 엄청나게 증가하고 있으며 밝혀진 miRNA 숫자가 폭발적으로 증가하고 있다. 그러나 불행히도 새롭게 발견된 이들의 거의 대부분이 불완전하게 해석되어 siRNA(small interfering RNA), 긴 RNA 조각 그리고 임의의 염기서열들과 진짜 miRNA를 구별하는 데 실패하고 있는 문제를 야기하고 있다.

 

○ miRNA 해석에 요구되는 사항이 증가하면서 해석에 필요한 여러 가지 기준을 충족시키지 못하는 추정상의 miRNA를 포함하는 miRBase 같은 공공 데이터베이스가 문제가 되고 있다. 염기서열을 다시 결정한 결과 앞서 분석된 많은 miRNA들이 siRNA이거나 tRNA, mRNA, 그리고 rRNA를 포함하는 긴 코딩하지 않는 RNA 조각으로 밝혀졌다.

 

○ miRBase에 있는 해석된 식물 miRNA 좌위의 거의 1/3이 기각(reject)되었으며 miRNA family의 3/4이 이 데이터베이스가 나쁜 데이터에 의해 오염되었다는 주장을 확인해 주고 있다.

 

○ miRNA family는 진화의 원칙선상에서 정의되고 있으며 식물 miRNA의 진화에서 어느 정도 보존되어있다는 것이 일반적으로 받아들여지고 있다. 그럼에도 불구하고 진화적 틀(frame)내에서는 식물종들 사이의 miRNA의 분포를 조직화(organize)하려는 시도는 거의 없었다.

○ 분류학적으로 많은 표본을 조사할수록 miRNA가 종의 기원보다 훨씬 일찍 진화해왔다는 것을 알 수 있다.

저자

Richard S.Taylor et al

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2014

권(호)

19(3)

잡지명

Trends in Plant Science

과학기술
표준분류

바이오

페이지

175~182

분석자

김*일

분석물

• 식물 마이크로 RNA의 진화역사.pdf [319,449 byte]

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