약용식물 동정을 위한 핵산 바코딩

전문가 제언

？전문가 제언？

 

○ 약용식물을 이용한 치료에 대한 점증하는 요구와 자원에 대한 증명 때문에 순종 식물재료 및 잡종가능성에 대한 정보를 포함하는 단일 데이터베이스를 만드는 것이 필수적이다.데이터베이스는 데이터재생을 위한 DNA바코드 및 유사성 탐색이 가능해야 한다.이러한 바코드를 얻기위해서는 약용식물자원의 증명 및 동정을 도울 수 있는 분자적 마커의 개발이 필요하다.

 

○ DNA바코딩은 마이토콘드리아 제놈의 사이토크롬 산화효소를 이용해서 동물에서 처음 시작되었으나 식물에서는 마이토콘드리아 유전자가 아주 낮은 대체율(substitution rate)로 천천히 진화하고있어서 바코딩에 적합하지 않다.따라서 식물의 바코드는 높은 대체율을 보이는 엽록체와 핵 제놈으로 옮겨지게 되었다.

 

○ The Consortium for the Barcode of Life Plant Working Group(CBOL)이 식물계(kingdom)에 있는 7개의 엽록체 제놈지역을 조사해서 matK와 rbcL을 식물바코드로 제안한바 있다.

 

○ rbcL은 일반적이나 종 구별 정밀도가 낮고 marK는 일반적이지는 않으나 정밀도가 높다.그러나 이 두가지 마커를 조합해도 아주 가까운 근연종의 경우에는 구별능력이 떨어진다. 중국의 BOL그룹은 아주 가까운 근연종의 경우에도 최대한으로 동정할 수 있는 두 가지 마커에 핵 ITS(internal transcribed spacer)를 추가하는 방법을 제안한 바 있다.

 

○ 제놈상의 지역뿐만 아니라 RAPD에 기반을 둔 DNA마커도 약용식물의 동정에 유용한 것으로 보고되고 있다.RAPD와 SCAR 마커도 몇가지 약용식물 재료를 동정하기위해서 개발되고 있다.

 

○ 현재 약용식물 DNA바코딩에 NGS기술을 이용한 발표는 핵내 제놈지역을 찾아내기 위해서 이용된 단 하나뿐이지만 NGS기술의 계속적인 개량과 참고할 수 있는 염기서열분석 데이터베이스가 대량으로 만들어짐에 따라 NGS기술이 계속해서 유망기술로 자리잡을 것으로 생각된다.

저자

Natascha Techen et al

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2014

권(호)

25()

잡지명

Current Opinion in Biotechnology

과학기술
표준분류

바이오

페이지

103~110

분석자

김*일

분석물

• 약용식물 동정을 위한 핵산 바코딩.pdf [299,823 byte]

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