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팬제노믹스를 통한 산업균주와 프로바이오틱스의 개량

전문가 제언: ○ 팬지노믹스(pangenomics)란 특정 환경내의 모든 생명체의 DNA를 분리, 동정하고 양을 측정하여 생물 종의 다양성과 그 기능을 연구하는 통유전체학이다. 비교유전체학은 개체간의 염기서열차이를 비교하고 이에 따른 영향을 규명하는 학문이다. 팬지놈은 종(species) 내에 존재하는 모든 개체의 전체 유전자 세트이며 코어 지놈은 종의 모든 개체가 공유하는 공통기능의 최소 유전자 세트이다. 종의 팬지놈과 코어 지놈의 비교는 복잡한 메커니즘을 해결하기위한 새로운 기능을 발견하고 지놈이 어떤 기능에 관련될 수 있는지를 해결할 수 있다.

○ 프로바이오틱스는 기능성 건강증진식품이나 식이보충제의 성분으로 소비되고 있다. 생균 프로바이오틱스가 가장 많이 함유된 발효식품은 요구르트, 치즈, 김치, 막걸리, 와인, 청국장(낫도)등이며 종균은 각종 유산균, 효모, 바실러스가 있다. 프로바이오틱스 소비의 이점은 위 장관 건강증진과 면역기능증진이 포함된다. 프로바이오틱스 종균은 75년 전부터 산업적으로 생산되어왔다.

○ 유전체 염기서열분석은 미생물을 특성화하는 효율적이고 경제적인 방법이다. 요구르트 유산균의 팬지놈 분석은 요구르트의 질감형성에 새로운 지식을 제공하였고 프로바이오틱균주의 팬지놈 분석은 새로운 효과기나 분자를 동정하게 되었으며 프로바이오틱스-숙주 특이성에 대한 식견을 제공하였다. 앞으로 팬지놈 분석을 통한 발효식품과 프로바이오틱스용 균주개량 전망은 매우 밝다.

○ 최근 DNA 염기서열분석 비용과 시간의 감소로 세균을 특성화하는 새로운 접근이 가능하게 되었다. 또한 동일종의 팬지노믹스는 발효산업용 균주와 프로바이오틱스를 이해하고 개량하는 새로운 계기가 되었다. 앞으로 전통발효식품과 프로바이오틱스관련 산업용 균주의 팬지놈분석은 기능성은 물론 유용균주분리, 균주개량, 안전성분석과 공정개선에 사용할 수 있는 많은 정보를 제공하게 될 것이다.

저자: Christel Garrigues etal.
자료유형: 학술정보