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박테리아에서 항-Shine-Dalgarno 서열에 의한 번역의 일시정지

전문가 제언: 리보솜에 의한 단백질 합성은 선형기질 상에서 일정하지 않은 속도로 일어난다. 리보솜의 일과성 일시정지는 단백질 표적화와 접힘을 포함한 다양하게 연계된-번역과정에 영향을 끼칠 수 있으며, 이 일시정지는 mRNA의 서열에 의해 여향을 받는다. 그래서 유전자암호의 반복성이 동일한 단백질이 상이한 비율로 번역되게 허용한다. 그러나 in vivo에서 번역의 일시정지의 위치와 기전에 대한 지식은 극히 한정되어 있다. 여기서 저자 등은 박테리아에서 리보솜-보호 mRNA 단편의 리보솜-정보수집-심층배열에 의해 번역 일시정지의 유전체수준의 분석을 실시하였다. 이 방법은 부동의 내인성 발현수준에서 대부분의 전사체에 따른 리보솜 농도 프로필의 고해상도측정이 가능하게 한다. 예상치 못하게 저자 등은 희귀한 tRNA에 의해 해독된 코돈이 영양이 풍부한 조건하에서 느린 번역으로 유도하지 않는다는 것을 발견하였다. 그 대신 암호화서열 내의 mRNA 내 리보솜결합위치인 Shine-Dalgarno(SD)* 양 특성이 편재하는 번역의 일시정지를 일으켰다. 변이된 항-SD 서열을 갖는 직교성 리보솜을 사용해서 저자 등은 일시정지가 mRNA와 번역하는 리보솜의 16S 리보솜 RNA 사이에 혼성화가 일어나기 때문임을 증명하였다. 단백질-암호화서열에서 체내 SD 서열은 소외되며 기준이 되는 SD 자리에 유사한 코돈과 코돈 쌍을 피하여 편향된 용법으로 유도한다. 저자 등의 결과는 체내 SD 양 서열이 번역 율의 주된 결정인자이며 박테리아 유전체의 암호화를 위한 포괄적 원동력임을 나타낸다.

저자: Gene Wei Li et. al.
자료유형: 연구단신