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자연변이와 적응연구에서의 단편염기서열

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○ 오늘날의 고효율염기서열분석은 생물정보학에서의 혁신적 진보와 함께 유래가 없을 정도의 정밀한 제놈분석을 가능케 하고 있다.그리고 단편염기서열(SRS)은 특히 식물생물학에서 넓은 범위의 문제점을 해결할 수 있는 유익한 수단이 되고 있다.

○ 단편염기서열과 다른 제놈연구를 새롭고 창의적으로 적용하는 것이 자연적 변이연구를 재정립할 수 있을뿐만 아니라 유전자와 제놈의 진화를 이해할 수 있을 것으로 생각된다.

○ 단편염기서열 분석기술은 특히 개별연구자들에게 비교적 적은 비용으로 어떤 흥미있는 생물체라도 전체제놈을 파악할 수 있는 기회를 제공하는 아주 강력한 수단이 될 수 있다.1001 아기장대 제놈프로젝트는 어떻게 단편염기서열 데이터가 식물에서 제놈변이를 아주 정밀하게 분석하는데 이용되고 있는가를 보여주는 좋은 예가 되고 있다.

○ 특정 분류군(taxon)에 대한 제놈정보가 없을때는 1001아기장대 프로젝트같은 구체적 프로젝트가 아주 귀중하다.그러나 정밀분석은 장시간이 소요되고 비용이 많이 들어 대부분의 시스템에서는 현재 실행하기 힘들다.다행이 단편염기서열에 기반을 둔 기술이 활용가능하기 때문에 모델시스템을 넘어 다양한 연구를 가능케 하고 있다.단편염기서열데이터로부터 새로운 제놈을 assembling 하는 것은 어렵지만 가용한 많은 도구들이 개량되고 있어 전체제놈의 완전분석이 반드시 필요한 것은 아니다.

○ 전사의 후생학적 조절은 단편염기서열 기술에 대한 연구를 확대할 수 있는 새롭게 부상하는 연구분야이다.아기장대에서 단편염기서열은 제놈전반에 걸친 싸이토신메틸화패턴과 돌연변이축적 계통에서 세대가 진전되는데 따른 그들의 안정성을 측정하기 위해서 적용되었다.

○ 향후의 연구는 후생유전변이가 유전적변이에 의해 야기되고 궁극적으로 어떻게 후생적변이가 표현형변이에 영향을 미치는가에 대해 이루어져야 한다.

저자: Ben Hunter et al
자료유형: 학술정보