복합미생물공동체 특이 유전자클러스터의 고해상도 메타게놈 접근

전문가 제언

○ 미생물 생태계의 주 연구목적은 환경과정에 연루된 미생물의 유전자 조직과 기능과의 관계를 규명하기 위한 것이나 대다수 환경 미생물의 99%는 배양이 곤란하여 메타게놈 접근이 풍부해지면 환경미생물학자들은 미생물공동체의 거대하고 다양한 유전자를 직접 탐색할 수 있어 이 분야에 집중되고 있다.

○ 문제는 미생물 메타게놈의 복잡성을 전적으로 대표할 수 있는 특정 유전자의 적절한 시퀀스깊이를 얻기는 극히 곤란하여 이들 공동체에 대한 의미 있는 결론도달이 용이하지 않다. 따라서 본고에서는 특이 유전자에 관한 보다 많은 정보수집에 유용한 메타게놈 접근방법을 검토하였다.

○ 특히 타깃 메타게놈 접근은 다양한 환경의 복합 미생물공동체에서 발견되는 중요한 유전자 진화 및 생태계패턴이나 기능을 통찰할 수 있어 고해상도의 특이 유전자 클러스터 접근법을 본고를 통하여 제시하고 있다.

○ 국내에서는 지질가수분해를 생산하는 토양 메타게놈 유전자 분석을 비롯하여 메타게놈 유래 미규명 유전자 발현에 관련된 특성조사나 퇴비에 서식하는 미생물군집에서의 특정 패밀리 분류방법 등 다양한 연구가 수행되었으며 앞으로도 메타게놈을 이용한 연구는 더욱 확대될 것으로 보인다.

○ 메타게놈은 한 종의 게놈 유전체를 말하는 것이 아니라 한 환경단위의 모든 종의 유전체 즉 일종의 혼합유전체를 말하는 것으로 메타게놈 접근기술을 효율적으로 활용하면 다양한 미생물 제제개발이 가능하지만 더욱 시급한 것은 환경샘플링, DNA 추출, 클로닝과 같은 실험기술의 향상과 함께 타깃 메타게놈 개발의 연구동향에 주목할 필요가 있다.

저자

H. Suenaga

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

환경·건설

연도

2012

권(호)

14(1)

잡지명

Environmental Microbiology

과학기술
표준분류

환경·건설

페이지

13~22

분석자

한*빈

분석물

• 복합미생물 공동체 특이 유전자클러스터의 고해상도 메타게놈 접근.pdf [239,261 byte]

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