생물적 환경정화를 위한 시스템생물학

전문가 제언

○ 생물적환경정화(bioremediation)는 근본적인 이해의 관점에서 보면 블랙박스로 여겨져 왔다. 그래서 성공하기도 하고 이유도 전혀 모른 채 실패하기도 한다.

○ 시스템생물학은 분자. 세포, 군락 그리고 생태계 수준에서의 상호작용과 네트워크를 조사하여 복잡한 생물계를 연구하기 위한 통합적인 연구방법이다. 개별구성요소 내의 이러한 상호작용에 대한 지식이 조사하고자 하는 생태계의 dynamics를 이해하는 데 필요하다.

○ 시스템생물학에서 사용하는 방법을 고르는 과정에는 경비, 시간계획, 인원 그리고 프로젝트의 목적이 포함된다. 만약 미생물군락의 구성을 알아내는데 초점을 맞추면 16S rRNA클론라이브러리, PhyloChip 또는 염기서열분석 같은 DNA기반 “omics”가 사용되어야 한다. 만일 미생물이 매개하는 반응에 관련된 기능유전자를 찾거나 세포경로를 이해하는 것에 관심이 있으면 GeoChip,RNA Seq, 그리고 다양한 mass spectro- metry 같은 RNA나 단백질을 동정하는 도구가 사용되어야 한다.

○ 만일 미생물에 의해 생산되는 작은 분자를 특성검정 하는 것이 목표이면 MALDI(matrix-assisted laser desorption/ionization), DESI (desorption electrospray ionization), 핵자기공명(NMR) spectroscopy가 사용될 수 있다.

○ DNA, RNA 그리고 단백질을 세포수준에서 분석할 수 있다. 그러나 세포에 대한 영향을 이해하고 그리고 구조와 기능관계에 대해 생물정화의 효과를 이해히기 위해서는 군락과 집단(population)을 분석해야 한다.

○ 기능성미생물군락 구조의 모델링과 모든 수준에서 환경 내 스트레스반응을 이해하는 것이 hydrobiogeochemical 과정과 생물적 정화연구를 성공적으로 이끌고 또 블랙박스를 밝혀낼 수 있는 잠재력을 근본적으로 이해하는데 커다란 의미를 지니고 있다.

저자

Romy Chakrabarty et al

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2012

권(호)

23

잡지명

Current Opinion in Biotechnology

과학기술
표준분류

바이오

페이지

483~490

분석자

김*일

분석물

• 생물적 환경정화를 위한 시스템생물학.pdf [293,718 byte]

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