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염기-쌍 분해능에서 효모 뉴클레오솜 위치의 지도

전문가 제언: ○ 단일-염기-쌍 분해에서 뉴클레오솜 위치들의 지도 작성은 RNA중합효소 활성도, 전사-인자 결합반응속도, DNA 복제, 동원체구조 등을 포함하는 광범위한 생물학적 과정들의 완전한 이해가 필요하다. 뉴클레오솜 지도-작성에 대한 가장 일반적으로 사용되는 방법은 히스톤핵심으로 보호되지 않는 DNA서열들을 분해하기 위하여 미세-구균의 핵산분해효소(MNase)로 염색질의 처리에 의존된다.

○ 뉴클레오솜 지도 위치들은 분해되지 않은 DNA서열분절들의 중심에 의해 간접적으로 추정된다. 이 방법은 뉴클레오솜 이해의 통찰력을 주지만, 읽은 길이들의 큰 변이성, MNase 서열의 우선권, 다른 DNA-결합단백질들의 간섭 등으로 그 위치가 부정확하므로 더 큰 정확성을 갖는 뉴클레오솜의 위치를 측정하는 다른 방법이 필요했다. 여기서 공작된 히스톤의 화학개질에 기초하여 편재된 히드록실기들이 재구성된 모노-뉴클레오솜 중심위치들을 직접 지도 작성하는 새로운 방법을 개발했다.

○ 최근에 인체게놈 서열지도의 완성과 각 개인들의 건강과 직결되는 연구가 뜨거운 이슈이지만, 이 효모에서 뉴클레오솜위치의 지도 작성은 국내외에서 처음 시도 수행하였다. 그 결과의 지도는 전례가 없는 상세하고 정확한 게놈-전반 뉴클레오솜 위치들을 지정했다. 그것은 in vivo 전사인자결합, 염색질섬유의 더욱 고질서구조 등에 관련되는 뉴클레오솜 조직의 새로운 면모들을 나타냈다.

○ K. Davies가 저술한 “The $1,000 Genome"에서 $1,000로 개인의 게놈 지도를 완성하는 시대가 되면 그 게놈지도의 유전자정보가 맞춤형 의학치료로 천수를 누릴 수 있음의 여부를 논했다. 이 연구의 효모에서 뉴클레오솜 위치지도가 뉴클레오솜 위치선정과 이들 다양한 과정들 간 밀접한 관계로 DNA복제, 재결합, 돌연변이, 게놈전개, 질병 등 유전학적 더 많은 과정들이 해명될 것이 예상된다. 또한 인간게놈서열지도의 독특한 부분집합으로서 생물학적 이론과 의학적으로도 미래에 활용성이 높이 평가된다.

저자: K. Brogaard et al.
자료유형: 학술정보