환경미생물학에 표현형 미세배열 분석법의 응용

전문가 제언

○ 환경에서 유용한 미생물을 찾아내거나 환경 상호간의 특징을 규명하기 위해서는 효과적인 시험 방법이 요구된다. 환경에 있는 미생물은 극히 다양한 분포를 보이며 단지 극히 일부분만이 성공적으로 실험실에서 배양되기 때문에 배양에 다양성이 요구된다.

○ 본 리뷰는 환경으로부터 여러 배양 조건에서 다양한 미생물을 신속하게 배양하는 미세 웰(well) 방법을 소개한다. 이 방법은 우선 성장 조건을 다양하게 제공하고 있으며 신속한 스크리닝이 가능하다. 또한 이 방법은 다수의 기질, 영양원, 그리고 억제제들을 갖추고 있다. 이들 억제제들은 한 미생물의 표현형을 평가할 수 있다.

○ 표현형 미세배열(phenotypic microarray, PM) 방법은 혐기성 미생물과 고온 미생물의 배양에 대해서 정리하고 있다. 나아가 스트레스 반응 연구에서 미세배열 기판의 사용 방법에 대해서 기술하고 있다. 또한 본 리뷰에서는 새로이 발견되는 균주에 사용되는 배지의 개발에 관한 최신의 문헌들을 소개하고 있다.

○ 환경에는 다양한 미생물이 다양한 상태로 존재한다. 환경에 존재하는 미생물을 연구하는 목적은 다양하다. 여기에서 소개하는 PM 방법은 특정 환경 구역에 존재하는 표현형을 평가하는 데에 사용되는 방법이다. 근래 국제 개방화에 따라서 국내 농업 경쟁력이 떨어짐에 따라 토양의 효율성을 높이기 위해서는 토양 미생물의 표현형을 조사할 필요가 높아지고 있다. 유용한 표현형 미생물의 확보를 위해서는 보다 다양한 조건에서 대량으로 미생물을 확보할 필요가 있다.

○ PM 방법을 유용하게 사용하기 위해서는 아직도 해결해야 할 과제들이 많다. 실험에서 얻어지는 자료의 해석과 가시화에서 여러 가지 고려할 점이 있다. 또한 얻어지는 자료에 대한 통계적 처리에 주의가 요구된다. 그러나 이러한 문제는 국소적으로서 앞으로 토양 미생물학 연구에 있어 PM 방법의 사용이 증가될 것으로 예상되어 이에 관한 연구가 요망된다.

저자

Sharon Borglin,

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2012

권(호)

23(1)

잡지명

Current Opinion in Biotechnology

과학기술
표준분류

바이오

페이지

41~48

분석자

신*오

분석물

• 환경미생물학에 표현형 미세배열 분석법의 응용.pdf [228,252 byte]

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