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미생물의 동정 및 기능 분석을 위한 FISH 기술의 새로운 추세

전문가 제언: ○ 근래 토양, 식물, 동물 및 사람에 존재하는 미생물을 신속하게 그리고 감도 높게 검사하는 방법에 대한 관심이 증가하고 있다. 이러한 목적으로 개발되어 사용이 증가되는 방법 중의 하나가 FISH(fluorescence in situ hybridization) 기술이다. 본 리뷰에서는 2008년 이후의 문헌을 중심으로 FISH 방법과 변형들, 그리고 이들의 원리, 장단점 등이 자세히 소개되어 있다.

○ FISH 기술은 rRNA 분자들에서 특징 구역을 탐지하여 미생물을 신속하게 직접적으로 단세포를 동정하는 절대적인 방법이 되고 있다. 근래 이 분야의 발전은 새로운 컴퓨터 도구를 이용하여 프로브 디자인을 하고 실험 조건들을 최적화하며 쉽게 수행할 수 있는 시그널 증폭 전략을 쓰고 있다.

○ 초기의 FISH 방법은 여러 형태로 발전해 오고 있으며, 특히 이 기술을 투과성 전자현미경이나 세포 외 염색 기술 등과 같은 다른 기술들과 병용하여 용도를 넓히고 있다. 또한 FISH 방법으로 찾아낸 세포들을 선별하여 단일 세포 유전체를 분석하며 단일 미생물 세포 내에 존재하는 특이 유전자를 직접적으로 탐지해 낸다.

○ 근래 개선된 방법들은 단일 세포 내의 유전체 분석과 특이 유전자를 탐지해 내기 위해서 시그널 증폭을 하는 등 여러 가지 전략을 구사한다. 즉 여러 종류의 FISH 방법들이 개발되고 있으며 이들은 또한 다른 기술들과 연계하여 유전자의 기능적 규명 등 소기의 목적을 이룬다.

○ FISH 기술들은 토양 내의 항생제 개발, 각종 질병 유발 미생물의 규명과 인체 내의 세균, 원충 및 바이러스 진단 등 그 용도가 다양하다. 국내에서도 이 기술의 조속한 도입과 사용을 위한 필요 조치가 이루어져야 될 것으로 생각된다. 또한 관련 진단제의 개발을 위한 연구가 수행될 필요가 증대된다.

저자: Michael Wagner, et al.
자료유형: 학술정보