제놈에서 메타제놈까지

전문가 제언

○ 차세대 분석기술로 메타제놈 연구를 수행하는 주요인은 경제성이며 얻어진 짧은 염기서열을 가지고 미생물군락에서 저비용으로 깊이 있는 분석시료를 얻어야 한다.

○ 기존의 프로그램상에서는 메타제놈의 단순한 염기서열의 유사성을 분석하는 문제조차도 제한적이며 데이터크기의 증가와 분석의 복잡성 때문에 지속적 연구가 어렵다.

○ 복합군락(complex community)의 메타제놈 염기서열 분석 데이터는 종종 군락 내의 아주 적은 부분만을 대표할 수도 있다. 따라서 군락 전체를 대표하기 위한 반복분석이 필요한데 이 분석의 필요성을 결정하는 프로그램이 필요하다.

○ 분석경비와 상관없이 군락 내 각각의 미생물의 염기서열을 반복해서 모두 분석할 수 있다면 메타제놈은 일반 제놈 분석과 비슷한 프로그램이 필요할 것이다. 그러나 이는 현실적으로 어렵기 때문에 새로운 컴퓨터프로그램이 개발되어야 한다.

○ 군락 내의 반복분석률이 낮을 때 염기서열 분석오차로 인한 변이를 어떻게 구별할 수 있는가 하는 문제가 생긴다. 따라서 분석된 염기서열의 질과 얻어진 정보의 충실도를 결정할 수 있는 방법을 찾아야 한다.

○ 현재 쓰이고 있는 대부분의 제놈 분석 방법들은 각각의 제놈 연구에 맞추어 개발되어 여러 종이나 계통이 혼합된 메타제놈 연구를 수행하는데 여러 가지 문제점을 내포하고 있다. 따라서 다른 패러다임의 분석시스템과 프로그램의 개발이 절실하다.

○ 제놈 및 메타제놈의 성공여부는 염기서열 분석기기의 성능이 아니라 분석을 위한 시스템과 컴퓨터프로그램이며 이의 개발을 위해서는 생물정보학의 활성화 및 생물정보학자를 양성하는 것이 시급하다.

저자

Narayan Desai

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2012

권(호)

23

잡지명

Current Opinion in Biotechnology

과학기술
표준분류

바이오

페이지

72~76

분석자

김*일

분석물

• 제놈에서 메타제놈까지.pdf [291,908 byte]

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