전사체(Transcriptome)의 해석

전문가 제언

○ 차세대 Sequencer(Next Generation Sequencer : NGS)를 사용해서 대량의 염기배열을 결정하게 하는 것이 가능하게 되었으며, NGS는 DNA의 배열 자체를 결정하는 것에 사용한다는 것은 물론이지만, 시료조제를 연구함으로써 유전자발현량의 계측 또는 그의 통제에 관계하는 인자를 해석하는 것에도 사용하게 된다.

○ 예를 들면 진핵생물의 세포에는 1세포당 50~100만 개 정도의 mRNA가 포함되어 있는 것으로 생각되고 있으나 이들의 배열을 모조리 결정하는 것이 될 수가 있다면 그의 수를 헤아리는 것으로써 어느 유전자가 몇 분자의 mRNA로 발현하고 있었는지를 해석할 수가 있다.

○ 또한, miRNA 등 염기 길이의 짧은 RNA배열, Cap구조 등의 특징적인 구조물의 근방에 존재하는 RNA배열, 또는 핵, 세포질, Polysome이라고 하는 특정의 세포내의 화분에 있는 모든 것의 RNA배열을 동정함으로써 여러 가지 국면에서 RNA의 동태를 계측할 수가 있다.

○ 더욱이 Chlp Seq와 유사한 방법을 RNA결합 단백질에 이용하게 한다면, 그 단백질이 어떠한 RNA하고 결합하고 있었는지를 해석하는 것도 가능하며, 염기배열을 결정하는 것이 소위 Sequencer라 하겠으나 그의 염기배열의 결정 이외의 사용법, 특히 mRNA발현량의 측정 등을 들 수가 있다.

○ 근래에 와서 특히 우리나라 임상 의료분야에서 Transcriptome해석으로 인한 응용에서 유전자의 수와 배열도 중점을 두고 있다. 이들을 해석 및 해독되는 결과가 다양한 임상질환의 결과를 알려주게 되었고, 그 결과 염기 배열 (gene sequence) 중에서도 다양형(polymorphism)을 규명할 수가 있다. 따라서 mRNA나 단백질의 발현을 정상상태(steady-state)로서 한 번에 다량으로 세포나 조직에서 발현을 조사하는 high through-put technology의 개발이 더욱 필요하게 되었다.

저자

Yutaka Suzuki

자료유형

학술정보

원문언어

일어

기업산업분류

바이오

연도

2011

권(호)

30(8)

잡지명

細胞工學

과학기술
표준분류

바이오

페이지

817~822

분석자

최*윤

분석물

• 전사체(Transcriptome)의 해석.pdf [240,801 byte]

이미지변환중입니다.