역전사 실시간 PCR 방법을 사용한 토양내 미생물 유전자의 정량적 분석

전문가 제언

○ 토양 미생물학의 이용 범위는 대단히 광범위하다. 항생제의 개발은 물론이고 근래에 대두되고 있는 여러 종류의 probiotics들이 토양에서 유래하고 있다. 따라서 토양 내의 미생물을 보다 많이 확보하고 이를 이용하기 위해서는 적합한 방법의 도입이 필수적이다. 따라서 본 리뷰에서는 이를 위하여 보다 많은 수의 미생물을 탐지할 수 있는 방법을 소개하고 있다.

○ 재래적 미생물 배양 방법으로는 일반적으로 토양 내에 존재하는 미생물의 2% 내외만을 배양할 수 있는 것으로 알려져 있다. 근래 보다 혁신적인 방법의 도입으로 배양률이 높아진 결과 14% 정도로 향상되었다. 그러나 배양 기술은 복잡하고 시간이 많이 걸리며 고가의 시약이 필요하다. 아직도 분자적 방법에 비하여 감도에서 떨어지고 있는 것이 사실이다.

○ 본 리뷰에서 소개하는 미생물 유전자발현을 정량화하기 위한 “정량적 역전사 리얼타임 PCR(quantitative reverse transcription real-time PCR. qRT-PCR)”은 이러한 결점을 보완할 수 있는 대단히 유용한 방법으로 알려져 있다. 보다 간편하며 감도가 배양법에 비하여 월등하게 높은 것으로 조사되었다.

○ 그러나 이 방법은 고도의 수행 기술이 요구된다. 토양에는 RNA의 시험을 방해하는 여러 가지 요인들이 있다. 억제물질의 존재와 물리적 조성이 RNA의 추출과 보존을 방해하고 있다. qRT-PCR 기술의 도입을 위해서는 이러한 여러 가지 기술적 난관을 해결해 나갈 필요가 있다.

○ 국내 농업의 생산성을 높이고 환경을 개선하며 여러 유용균의 확보를 위해서는 토양내의 미생물에 대한 정확한 파악이 요구된다. 이를 위해서는 qRT-PCR 방법의 도입과 정확한 실험 수행을 위한 각종 연구가 필수적으로 요구된다.

저자

Saleema Saleh-Lakha, et al.

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2011

권(호)

85(3)

잡지명

Journal of Microbiological Methods

과학기술
표준분류

바이오

페이지

239~243

분석자

신*오

분석물

• 역전사 실시간 PCR 방법을 사용한 토양내 미생물 유전자의 정량적 분석.pdf [275,040 byte]

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