단백질체 연구에서 LC/MS의 활용

전문가 제언

○ 상압 하 이온화 기술인 ESI(electrospary ionization)의 개발은 액체크로마토그래피-질량분석기(LC/MS)의 결합에 의한 단백질 분석에 새로운 전기를 마련하였다. 생물체의 유전자에 의하여 표현되는 단백질체 연구에서 LC/MS는 단백질과 펩티드의 분리와 확인을 위한 가장 강력한 도구로 활용되고 있다.

○ 초기의 단백질 분해에 의한 펩티드의 분자량을 측정하여 데이터베이스 검색을 통한 단백질을 확인하는 "peptide mass fingerprinting"에서 전 단백질체를 효소 분해하여 MS/MS로 분리된 펩티드를 확인하는 “shotgun proteomics"가 활용되고 있다. CID, ECD, ETD(electron transfer dissociation) 같은 MS/MS 이온화 기술은 번역 후 변형 위치측정에 더욱 완전한 정보를 제공함에 따라 완전한 단백질을 직접 분석하는 하향식(top-down) 단백질체 분석이 가능하게 되었다.

○ 최근 우수한 분해능, 감도와 피크용량을 가진 UHPLC와 MS를 결합한 UHP-MudPIT 기술의 개발로 복잡한 혼합물의 분석이 가능하게 되었고, 마이크로유체 시스템을 LC에 도입하면서 펩티드의 분리효율이 더욱 우수한 HPLC-chip을 이온포획 질량분석기에 결합하여 재래의 nano-LC/MS/MS에 비하여 획기적인 고감도 기기가 단백질체 분석에 활용되어 표적 단백질 분석과 바이오마커의 발견을 포함한 신약 개발에서 가장 유력한 도구로 활용될 것이다.

저자

Guodong Chen and Birendra N. Pramanik

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

바이오

연도

2009

권(호)

14

잡지명

Drug Discovery Today

과학기술
표준분류

바이오

페이지

465~471

분석자

엄*윤

분석물

• 단백질체 연구에서 LC-MS의 활용.pdf [343,133 byte]

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