Proteomics가 개척할 세포주기 연구

전문가 제언

○ 인산화나 Ubiquitin화 등의 단백질의 번역 후 수식에 관여하는 많은 효소가 세포주기 통제에 있어서 중요한 역할을 담당하고 있다. 하지만 이들 효소 중에는 생리적인 표적기질이 밝혀진 것은 의외로 적으며 이들의 효소와 그의 표적기질의 대응관계의 해명은 세포주기 통제 메커니즘을 이해하는 데 매우 중요한 의미를 갖는다.

○ 세포주기 해석에서 in vivo 표식법은 대사적으로 안정동위체(安定同位?)를 거둬들여 단백질을 표식하는 방법으로 안정동위체 표식은 아미노산을 이용하는 방법, 즉 SILAC(Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture법)이 가장 많이 보급되고 있다.

○ in vitro 표식법으로는 ICAT(Isotope-Coded Affinity Tags)/cICAT (cleavable ICAT)법이 유명하나 최근 새로운 정량법으로서 iTRAQ (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)법이 개발되어 관심을 갖게 되었다.

○ 이것은 4종류의 iTRAQ 시약으로 펩티드를 표식하는 방법으로 SILAC법이나 ICAT/cICAT법하고는 다르며, 이들의 펩티드의 질량이 완전히 동일하기 때문에 MS 스펙트럼 상에서는 단일 peak로서 검출되나 CID(Collision-Induced Dissociation)에 의한 개열(開裂)에 의해서 MS/MS 스펙트럼 상에서 질량이 다른 4종류의 운반 이온이 저질량 영역에서 관측하게 되며 그의 강도로서 정량이 가능하다.

○ 이러한 방법은 한 번에 복수 point로서의 정량이 가능하며 세포주기 해석과 같은 시간 축에서의 정보가 필요할 경우에 매우 유효하다. 따라서 in vivo 표식법으로서의 SILAC법과 in vitro 표식법으로서의 iTRAQ법이 주로 정량 proteome 해석에 사용되고 있다.

저자

Masaki Matsumoto, Keiichi Nakayama

자료유형

학술정보

원문언어

일어

기업산업분류

바이오

연도

2009

권(호)

28(1)

잡지명

細胞工學

과학기술
표준분류

바이오

페이지

59~64

분석자

최*윤

분석물

• Proteomics가 개척할 세포주기 연구.pdf [382,976 byte]

이미지변환중입니다.