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생물정보 소프트웨어 EMBOSS에 의한 배열정보해석

전문가 제언: ○ 유럽에서 개발된 생물학 오픈소스소프트웨어인 EMBOSS(The European Molecular Biology Open Software Suite)는 약 170 정도의 프로그램이 통합되어 있는 생물정보학 프로그램이다. 모두 오픈소스프로그램이기 때문에 무료로 다운받아 설치가 가능하여 무료로 사용할 수 있다.

○ 그러나 Unix, Linux 환경에서 작동되기 때문에 관련 명령어를 알아야 한다. 그리고 프로그램의 실행이 모두 명령어에 의해 작동되기 때문에 프로그램 명령어를 알아야 한다는 불편함이 있다. 최근에는 이러한 불편한 점을 일부 해소하기 위해 Java로 GUI를 구현하는 Jemboss가 출현하였다.

○ 최근에 등장한 생물정보학(bioinformatics)은 생물학(biology)과 정보학(informatics)이 결합된 분야로 넓은 의미로는 컴퓨터를 이용한 생명과학의 전부를 말하며 좁은 의미로는 DNA와 단백질의 서열과 구조에 관한 정보를 관리하고 이용하는 학문분야이다.

○ 생물정보학은 컴퓨터와 소프트웨어를 활용하여 유전자의 염기 서열 데이터를 분석하고 기능을 재구성하여 생명공학에 응용할 수 있도록 하는 학문이다. 분자생물학, 유전공학의 발달과 게놈 프로젝트의 결과로 얻은 많은 정보는 체계적인 데이터베이스를 구축할 수 있어, 생물학 현상에 관한 데이터를 이용하여 생물체의 기능과 형태를 해석하고 모델링하는 것을 도와준다.

○ 생물정보학은 특히 1990년대 후반에 들어서면서부터 Human Genome Project(HGP)의 활성화와 DNA 칩(chip) 등의 발달로, 더욱 많고 풍부한 데이터로부터 유용한 정보를 얻고자 하는 다양한 연구가 수행되어 왔으며 현재도 계속 연구가 진행되고 있다. 그리고 향후에도 더욱 발전된 생물정보에 대한 연구와 노력이 계속 시도될 것으로 추측된다.

저자: Mitsuhiro Tagaya
자료유형: 학술정보