내 신청현황
종류	모집공고명	진행상태
신청내용이 없습니다.

알림마당

home

진핵세포 게놈에서 마이크로 세트라이트를 찾아내는 일

전문가 제언: ○ 진핵세포의 유전체 시퀀스 데이터가 축적되면서 마이크로세트라이트(microsatellites)의 기원과 기능에 대한 이해가 진전되고 최근 유전자 마커의 가장 인기 있는 제원이 되고 있으며 또 새로운 분야에 응용을 위한 연구도 계속되고 있다.

○ 마이크로세트라이트(microsatellites)는 단순서열반복(SSRs) 혹은 짧은 직렬반복(Short Tandem Repeats)이라고 하며 이들은 특정한 DNA 서열을 가지고 하나에서 여섯 개의 뉴클레오티드가 반복된 단위이다. 예를 들면 (A)11, (GT)9, (CTC)12, (GATA)8, (ATCGC)4와 (ATTGCC)5를 mono-, di-, tri-, tetra-, penta-, hexa-nucleotide 반복이라 한다.

○ 이 서열은 원핵과 진핵생물에서 흔하게 있으며 코드를 하는 부위와 안하는 부위 모두에서 볼 수 있다. 반복이 연속된 것(Perfect: (GTG)15), 연속되지 않은 것(Imperfect: (GTG)7CTCTG(GTG)8로, 혼합된 것(Compound: (GTG)8(AT)16)으로 나눈다.

○ 이 리뷰에서는 진핵세포 게놈에서 microsatellites를 찾는 과정의 진전과 그것들의 분포와 역학에 대한 여러 가지 단면을 기술하고 있으며 특히 microsatellite를 찾는 두 가지 전략, 즉 찾는 도구와 적절한 데이터베이스에 접근하는 방법에 대해서 탐사하고 있다.

○ 진핵생물의 유전체 가운데는 단백질을 코드하는 이외의 염기서열이 대부분을 차지하고 있다. 전체서열에는 특기할 만한 서열들도 있어 간단한 서열반복 혹은 마이크로세트라이트(microsatellite)는 그들의 재현능력, 여러 개의 대등인자, 공동우성모드의 유전, 게놈에 널리 깔려 있기 때문에 가장 우수한 유전적인 마커의 종류로 진전되어 왔다.

○ Microsatellite의 밀도와 분포는 게놈에서 다르게 나타나고 마이크로세트라이트 좌위에서 높은 돌연변이는 유전자 풀에 유전적인 진화를 만들어 내는 역할을 하는 등 아직도 연구해야할 부분이 많아 그 적용가치도 높아지리라 생각한다.

저자: Sharma, PC; Grover, A; Kahl, G; AF Sharma, Prakash C.; Grover, Atul; Kahl, Guenter
자료유형: 학술정보