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새로운 NMR 수법에 의한 고분자 결합과정에서 생성되는 중간상태의 동정

전문가 제언
○ 최근 다양한 고분자복합체의 입체구조가 밝혀지면서 그 많은 정보량의 단백질-DNA 복합체에 관련된 팽대한 양의 자료가 PDB(Protein Data Bank)에 등록되고 있으며 이들 복합체의 구조는 생체고분자의 분자인식을 이해하는데 필요불가결한 것이나, 이들 복합체는 안정한 상태에 있는 최종적인 복합체의 구조에 관한 것이며 이들이 형성되는 과정의 경로에 대한 정보의 제공은 불가능하다.

○ 생체고분자 사이에 형성되는 복합체에는 중간상태가 존재하며 이 중간체가 복합체 형성속도를 증가시키는데 관여하며 또 단백질-DNA 복합체 형성과정에서 먼저 비특이적인 복합체가 비특이적 DNA 부위에서 형성되며 단백질은 DNA 위를 확산하면서 특이적인 배열을 탐색하는 소위 타깃 서치 과정을 거쳐 안정한 최종 복합체의 구조를 가지게 되며 또 단백질-단백질 복합체의 형성에서도 상호작용하는 단백질 끼리 만나서 정전상호작용에 의한 비특이적인 약한 결합한 상태인 조우복합체를 거쳐 최종적으로 특이적인 복합체에 이른다는 보고도 있다.

○ 복합체 형성과정 중 생성되고 소멸되는 중간상태의 복합중간체를 물리화학적으로 직접 해석하는 것은 저농도와 시간적 제약으로 매우 어려운 일이며 원리적으로는 최종복합체의 결정해석보다는 용액상태를 관측하는 NMR법이 평형상태에 있는 복합체 형성과정의 중간상태의 해석에 적합하다.

○ 그러나 중간상태의 특성 상 평형상태에서 존재비율이 낮고 다양한 비특이적인 결합상태가 혼재하고 있으므로 일반적인 NMR 기법으로 이를 조사하기는 거의 불가능에 가까우나, 본 고의 필자는 최근 생체고분자반응의 중간상태를 해석하는 상자성 완화촉진을 이용한 새로운 NMR 기법을 개발하고 그 원리와 단백질-DNA 복합체 및 단백질-단백질 복합체의 형성과정에 응용하여 얻은 결과를 소개하고 있는데, 생체고분자복합체 연구자에게 매우 유익한 자료를 제공하고 있는 것으로 사료된다.
저자
Junji Iwahara
자료유형
학술정보
원문언어
일어
기업산업분류
바이오
연도
2007
권(호)
52(9)
잡지명
蛋白質·核酸·酵素
과학기술
표준분류
바이오
페이지
952~958
분석자
마*일
분석물
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