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고아대사활성의 분포

전문가 제언
○ 고아효소활성(orphan enzyme activity)이란 기관(organism)의 대사반응에서 본 반응을 책임지는 어떤 유전자도 동정되지 않은 활성반응으로 어느 기관에서도 단일 대표유전자 없이 활성을 보이는 글로벌고아와 특정기관에서만 유전자가 확인되지 않은 로컬고아로 대별된다. 본고에서는 글로벌 고아에 대한 효소분류의 문제점을 요약한 자료로 생화학이나 분자생물학이 크게 주목하여야 할 사안이다.

○ 국제생화학회의가 생화학반응 분류를 위해 1955년 효소협회(EC: Enzyme Commission)를 발족한 이후 4,000여 고아효소활성이 확인되고 있다. 미국 Irving Cancer Research Center Chen 박사팀은 국제적 시퀀스 검색 데이터베이스의 SWISSPROT, TrEMBL, PIR, MetaCyc와 효소 D/B세트 등에서 글로벌 고아대사활성을 동정한 결과 34%는 EC number가 부여되어 있었으며, 본 자료를 근거로 고아활성의 역사적인 자료축적현황, 생화학 공간에서 고아활성의 분포 및 고아활성의 기관분포현황을 요약하여 몇 가지 문제점을 지적하였다.

○ 거의 알려진 생화학특성이나 효소반응도 미 분류 상태로 남아 있었으며, 현재도 분류가 진행되고 있지만 고아활성의 분획(fraction)은 여전히 증가하고 있음을 KEGG D/B와 MetaCyc D/B에서 확인하였다. 일부이긴 하지만 약 5%는 이미 유전자가 확인된 불합리한 분류를 보였으며 미 분류 수치를 합하면 현재까지 알려진 전체 고아반응의 약 절반 이상에 해당한다는 지적은 보다 체계적이고 신속한 분류를 독력하는 계기가 되었으면 한다.

○ 본 자료는 분자유전학의 급속한 발전과 더불어 omics, 단백질체학, 대사체학 등이 세분되고 있어 생화학반응에 대한 기본 메커니즘의 비 고아활성의 관련유전자나 고아활성의 대사기전을 정확히 파악할 수 있다면 생화학 기초연구는 물론 각종 의약품 개발이나 암 치료방법의 도입에도 크게 기여할 것으로 보여 국제적 차원의 보다 세밀한 연구가 추진되어야 할 것이다.
저자
Chen, LF; Vitkup, D; AF Chen, Lifeng; Vitkup, Dennis
자료유형
학술정보
원문언어
영어
기업산업분류
바이오
연도
2007
권(호)
25(8)
잡지명
Trends in Biotechnology
과학기술
표준분류
바이오
페이지
343~348
분석자
한*빈
분석물
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