단일 뉴클레오티드 다형성에 대한 자료 분석

전문가 제언

○ 개개인의 유전형질의 차이를 나타내는 DNA의 염기배열 변이인 단일 뉴클레오티드 다형성 지도(SNP map)가 미국의 Perlegen Science 사에 의하여 2005년도에 발표된 바 있다. 또한 두 번째 SNP 지도가 국제 HapMap 사업(international Hapmap project)에 의해 1단계 자료작성이 완성되어 Perlegen Science 사가 발표한 지도보다 더 많은 자료를 담게 된다. 이러한 SNP 지도는 향후 질병의 원인규명, 의약품의 개발 및 난치병 치료에 커다란 공헌이 기대되고 있다. 그런데 이러한 SNP 지도 작성에는 SNP의 자료에 대한 정확한 데이터 분석이 필수적이다.

○ 따라서 재래식 방법으로는 대량의 SNP 자료를 분석하는데 한계가 있기 때문에 컴퓨터에 의한 신호처리 기술과 통계적 방법을 응용한 SNP 자료처리가 여러 가지 방법으로 제안 되고 있는 실정이다. 예를 들면 SNP 자료작성에서 SNP가 검색되지 않는, 결측 자료(missing data) 처리는 대단히 중요한데 일배체형 추론에 일반적으로 사용되는 툴은 Dirchlet 전제를 사용하여 모집단 진화이력에 대한 가정 없이 Bayesian 절차를 적용한 HAPLOTYPE 알고리즘 등을 들 수 있다.

○ 우리나라도 2008년 5월까지 ‘한국인의 일배체형 정보개발사업’과 ‘동북아 민족 기능성 게놈 연구사업’을 추진한다고 발표한 바 있다. 이는 BIT 융합 생물정보학(bioinformatics) 활성화를 위한 것으로 사료된다. 또한 2007년까지 두 사업을 통해 의학적으로 유용한 한국인 SNP 자료를 발굴, 한국인 일배체형 지도를 작성할 계획이라고 밝힌 바 있다.

○ 그러나 우리나라는 선진국에 비하여 이러한 바이오 분야와 수리통계학의 연계에 대한 기술력이 뒤처진 상태로 특히 SNP 자료 분석에 대한 신호처리 기술 등 생물정보학 분야가 미약한 실정으로 이 분야에 대한 정부의 계속적인 지원과 산학연의 분발이 요구된다.

저자

Su, SC; Kuo, CCJ; Chen, T; AF Su, Shih-Chieh; Kuo, C. -C. Jay; Chen, Ting

자료유형

학술정보

원문언어

영어

기업산업분류

전기·전자

연도

2007

권(호)

24(1)

잡지명

IEEE SIGNAL PROCESSING MAGAZINE

과학기술
표준분류

전기·전자

페이지

75~82

분석자

박*준

분석물

• 단일 뉴클레오티드 다형성에 대한 자료 분석.pdf [247,537 byte]

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