β-Globin유전자 좌 조절의 “구조와 기능”

전문가 제언

○ 사람의 β-Globin 유전자 조절 부위(beta-globin locus control region hypersensitive site-2)에 대한 염색질(chromatin)구조를 조사하기 위하여 다양한 footprinting 시약을 사용하게 된다. HS-2(hypersensitive site-2)는 조직 특이적으로 DNase1 효소에 의해 쉽게 손상되는 부분으로 유전자 좌 조절 부위(LCR)에 위치한다. HS-2를 포함한 적혈구 세포주인 K562세포는 bleomycin, nedamycin, nitrogen mustard 등 여러 footprinting 시약으로 처리하게 되나 bleomycin과 hedamycin은 nuleosome(염색체의 기본 단위)의 연결 부위를 선택적으로 절단할 수 있는 DNA손상 시약이므로 사용 시 적절한 주의가 요망된다.

○ 염색질 면역침강(chromatin immunoprecipition) 분석으로 유전자 조절부위(LCR; Locus control region)에 NF-E2나 polⅡ가 결합한다. β유전자 촉진인자 부위에는 NF-E2 결합배열이 존재하지 않음에도 불구하고 같은 인자가 유치된다는 것이 밝혀져 전사인자 복합체가 어떤 메커니즘에 의해 LCR에서 프로모터 쪽으로 전이되는가를 알게 된다.

○ 염색질 배치 포획(chromatin conformation capture)분석으로 세포 내 염색질을 포르마린으로 고정하고 DNA를 정제한 후, 제한효소 처리 및 ligation(DNA나 RNA 끝을 이어주는 과정)을 거쳐 최종적으로 PCR반응을 하게 된다. 핵 내에서 2개의 DNA영역이 가깝게 위치하고 있으면 PCR에서의 산물이 생기게 된다. 이와 같은 방법의 활용으로 마우스의 태자 간세포(완성기에서)에 있어서 LCR과 β유전자 영역이 가까운 위치에 있는지 아닌지를 탐색할 수 있는 방법이 된다.

저자

KEiji Tanimoto

자료유형

학술정보

원문언어

일어

기업산업분류

바이오

연도

2006

권(호)

25(1)

잡지명

세포공학(N203)

과학기술
표준분류

바이오

페이지

17~22

분석자

최*윤

분석물

• β-Globin유전자 좌 조절의 “구조와 기능”.pdf [225,495 byte]

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