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단백질 동력학의 NMR 연구에 사용되는 새로운 도구들

전문가 제언
○ NMR의 최근 이용방법은 괄목할 만한 진보를 보여 단백질 동력학 특성을 이해하게 하며 이들 분자들의 기능적 메커니즘을 이해하는데 이용되고 있다. 한편 구조적 유연성이 단백질분자의 기능에 중심역할을 하며 많은 NMR 실험 데이터로부터 이들의 내부적 운동을 시간과 공간적 해상도로 탐구할 수 있다. 이처럼 단백질 동력학을 NMR로 연구하면 기능과 운동 간의 상호관계를 이해하게 된다.

○ 단백질과 작은 분자 리간드와의 상호작용은 생물학에서 아주 중요한 역할을 하며 이 상호작용을 예측하고 조작하는 기술은 생명공학연구 및 치료제개발에 새로운 장을 열어 줄 것이다. 특히 단백질-작은 분자 상호작용은 새로운 약물을 설계하는데 필수적이다. 이 때 가장 중요한 것은 단백질과 리간드 입체구조적 동력학을 이용하여 리간드 결합의 열역학적 상황을 결정하는 것이다. 이 문제를 다루자면 리간드가 있을 때와 없을 때의 단백질 동력학을 NMR 완화분석을 통하여 얻고 등온적정 칼로리미터(isothermal titration calorimetry, ITC) 및 모델 계산으로부터의 데이터와 통합하여 이용한다.

○ 동위원소 라벨된 단백질의 이질 핵 NMR에 진보는 완화 계수들과 단백질의 NH 골격의 모든 동력학 계수를 측정할 수 있게 하였다. 많은 단백질에 대한 이들 계수와 측정치를 포함하는 Indiana Dynamics Database (IDD)가 연구자들에게 열려 있으며 이는 웹사이트 http://pooh.chem.indiana.edu/IDD를 통하여 열람할 수 있다. 이 데이터베이스의 목적은 (1) 한 자료로 전자교환 완화와 동력학 데이터들을 공개하여 NMR 연구자들에게 제공하고 (2) 구조-동력학 관계를 설명하는데 동력학 데이터의 통계학적 분석을 촉진하며 (3) 동력학 데이터 분석을 실험하고 비교하는 연구를 촉진하기 위한 것이다.
저자
Mittermaier, A; Kay, LE
자료유형
학술정보
원문언어
영어
기업산업분류
바이오
연도
2006
권(호)
312
잡지명
SCIENCE
과학기술
표준분류
바이오
페이지
224~228
분석자
이*현
분석물
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