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NRM로 탐색하는 약한 단백질-단백질 상호작용

전문가 제언: ○ 약한 단백질-단백질 상호작용들 (PPIs)은 가역적 세포-세포의 접촉, 신속한 효소의 대사회전, 큰 신호 복합체의 일시적인 집합 혹은 재 집합 등의 많은 세포과정에 기본이 된다. 그러나 이들의 구조적 그리고 기능적 특성을 밝히는 것은 기술적으로 많은 어려움이 있어 강한 PPIs에 대한 지식에 비하여 많이 뒤떨어져 있다. 최근에는 본문에서와 같이 NMR을 주로 한 기술로 이들의 탐지내지는 구조규명이 가능하여 단백질이 어떻게 살아 있는 세포내에서 기능을 하는지를 이해하게 하여주고 있다.

○ 현재는 많은 데이터에 힘입어 다양성을 나타내는 PPIs의 진화적, 기능적 그리고 구조적 원리가 이해되기 시작하고 있다. 최근의 단백질 네트워크의 연구에 의하면 많은 단백질이 한 가지 이상의 다수 단백질 복합체나 이중 상호작용에 관여하고 있어 일시적 상호작용을 포함한 PPIs의 다수특이성 그리고 역동성을 보여주고 있음을 알려주고 있다. 이들 다수성분의 일시적 복합체들이 자세한 구조 및 동역학 면에서 특성이 규명되어야 한다. 이들 복합체의 기능성 정당성이 알려지지 않고 있어 현재는 최종적으로 이들의 진화과정에서 기능의 최적화가 각각 복합체의 관찰된 특성을 결정하게 된다. 그러나 앞으로의 연구로 단백질 복합체의 이해가 넓어질 것이고 합리적인 모델이 성립되어 구조와 동역학 및 기능을 예측할 수 있게 될 것이다.

○ 국내의 연구로 게놈 스케일 검정기술로 확인된 많은 PPIs 데이터 중 일반적으로 고효율 데이터세트가 높은 false positive rate를 가지고 있는 것을 이화여대 컴퓨터공학과에서 신경네트워크 알고리즘에 기초한 시스템으로 이들을 가려내는 새로운 신뢰평가 시스템을 개발하였다는 보고가 있다. 즉 이들은 효모의 PPIs를 이용하여 실제로 상호작용하는 쌍을 noisy 데이터 세트에서 평균 96%의 신뢰도로 구별해 낸다고 보고하고 있다.

저자: Vaynberg, J; Qin, J
자료유형: 학술정보