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높은 적합도 exo+ DNA 중합효소에 의해 매개되는 교정 유전자형 분석(polymeraseProofreading genotyping assays mediated by high fidelity exo(+) DNA polymerases)

전문가 제언: □ SNP(Single Nucleotide Polymorphism;단일 뉴클레오티드 다형성)분석에 있어서 새로운 유형으로 exo+ 중합효소의 적합성에 대한 유리한 점을 이용하여 게놈 수준으로 유전자형을 만들기 위하여 개발되고 있으며 SNP에 대한 선별법으로서의 분석으로, 아니면 새로운 SNP에 대한 규명으로 이용할 것인지에 따라 크게 두 범주로 구분되며, 알려진 SNP 검출에 대한 기술도 효소를 기본으로 하는 기술과 혼성을 기본으로 하는 기술 두 그룹으로 넓게 분류할 수 있다.

□ 효소에 있어서의 다양성은 중합효소(Polymerase), 아피라제(apyrase : ATP의 특이적 가수분해를 촉매하는 효소), 라가아제(Ligase), 핵산 말단 가수분해효소(exonuclease), 핵산 내부 가수분해효소(endonuclease)를 포함하며 상호이질 SNP분석에 일반적으로 사용되고 있으며 돌연변이 검출에 있어서 exo+ 중합효소의 적용은 흔히 이용되는 유전학적 분석이나 이의 적용에는 뜻하지 않은 장애가 있을 수 있음을 유의하여야 한다.

□ SNP 분석에 있어서 높은 적합도를 갖는 중합효소는 단일 염기 식별에서 영향력이 크게 작용하여야 하며 생체 내에서의 DNA 복제시 exo+ 중합효소는 핵산의 높은 적합도 합성을 잘 수행하나 대립형질에 특이적인 프라이머 신장에서 exo+ 중합효소를 적용하였을 시 3‘ 불일치 뉴클레오티드 문제가 제기됨으로써 3’ 핵산 말단 가수분해효소 활성이 3‘ 불일치 프라이머의 신장을 허락하게 된다는 사실에 유념하여야 한다.

□ SNP분석에서 exo+ 중합효소가 비 교정 효소(non-proofreading equivalent)에 비하여 한 단계나 두 단계 이상 높은 복사 적합도(複寫適合度)를 보이기 때문에 다양한 교정 분석 포맷이 미래에는 일반적으로 사용될 것으로 기대되며 교정 유전자형 분석의 응용성은 여러 DNA에서 대립형질 빈도평가와 종양 진단 및 치료적 예견에 대한 돌연변이 검출과 기초적인 임상적 적용에 이용하게 됨으로써 후기 게놈영역에서의 돌연변이 분석의 발전을 가져올 것으로 기대된다.

저자: Zhang, J; Li, K; Pardinas, JR; Sommer, SS; Yao, KT
자료유형: 학술정보