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단백질 칩 시스템

전문가 제언
□ 단백질 해석법

○ 2차원 전기영동으로 분리한 단백질의 해석은 주로 다음 순서로 실시한다.
- 환경변화에 따라 이동하는 단백질을 화상처리법 등을 이용해서 관찰한다.
- 단백질 spot를 잘라 겔 속에 특이적 protease로 소화하고 겔로부터 용출된 peptide 단편의 질량수를 질량분석으로 분석하여 데이터베이스에 접근한다.
- 경우에 따라 상기 펩티드 단편의 아미노산 서열을 MS/MS법 또는 PSD(Post Source Decay)법으로 결정한다.
이러한 순서로 진행하는 방법을 Peptide Mass Fingerprinting이라 부르며 이 방법으로 기자유전자와 단백질과의 대응관계를 추정할 수 있다. 그러나 실제로는 단백질의 기능을 해석하는 경우 다수의 단백질에서 발생한 번역 후 수식잔기를 결정하지 않으면 안 된다.

□ Tandem Mass Spectrometer

○ 전장과 자장을 이용한 고분해능 질량분석기로서 다양한 이온 source와 high energy collision을 이용한 탠덤 기법으로 단백질과 같은 생체고분자물질의 구조해석과 high resolution GCMS 등에 이용한다.

□ 앞으로의 과제

○ 1990년대 후반부터 지금까지 다양한 생물의 게놈 염기서열을 결정하고 있으며 인간게놈의 전체 염기서열 결정도 완성되었다. 그러나 게놈 해석이 진행됨에 맞추어 그 기능을 추정할 수 있는 단백질은 의외로 적다. 따라서 포스트 게놈 연구로서 개개의 단백질 기능을 효율적으로 해석하는 방법의 개발이 시급하다. 범국가적인 정책적 연구지원 체제가 절실히 요청된다.
저자
Dakeshi KARASAWA
자료유형
원문언어
일어
기업산업분류
바이오
연도
2003
권(호)
90(10)
잡지명
OHM(A086)
과학기술
표준분류
바이오
페이지
47~52
분석자
김*영
분석물
담당부서 담당자 연락처
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